До того, как возглавить институт, Андрей Лебезов был его исполнительным директором. Сейчас он занял место генерального директора, которым был Александр Тузов.
В настоящее время Александр Тузов – первый заместитель гендиректора компании «Наука и инновации». Он руководит работой по созданию единого научного центра Росатома, который объединит Физико-энергетический институт и Научно-исследовательский институт атомных реакторов.